Nel secolo XV° e XVI° Villa d'Almè costituiva comune con Almè e si divise da questo verso il 1600. Nel 1927 venne nuovamente unito ad Almè ridiventando comune autonomo con Bruntino nel 1948. Il comprensorio comunale, fin dal tempo dell'occupazione romana, era interessato da importanti strade carrozzabili che permettevano una sollecita comunicazione con i centri maggiori e con la Valle Brembana. Villa fu residenza di principi e governanti di Bergamo. Esistevano pure castelli e fortificazioni di cui ora rimangono solo i ruderi di un antico portale. Sotto la dominazione veneta fu importante sede di fonderie dei cannoni dei quali si serviva la Serenissima per i suoi eserciti e la sua flotta. La strada "Priula" per la sua comunicazione con la Valtellina, attraversava il suo territorio. Da quanto sopra e' stata ricavata la blasonatura dell'arma comunale di Villa d'Almè, avente le seguenti caratteristiche: Blasonata in rosso a tre cotisse d'Argento poste in banda a rammentare la rete stradale. Il tutto caricato da una Villa Patrizia con mura merlate alla ghibellina. Segni esterni del comune sono: Corona turistica e due rami uno di olmo e l'altro di vite a significare zona agricola. Il Gonfalone del Comune nei colori rosso-giallo della provincia riporta pertanto l'arma soprascritta.

Eretta nel 1700, conosciuta come la "Cesina dei Morcc de la Scalba", a ricordo della peste del 1630 (tra Villa e Bruntino si ebbero 348 morti) e' legata a una leggenda: il 2 Novembre di ogni anno, quei morti scendevano in processione dal bosco soprastante, dove erano stati sepolti in una fossa comune, e raggiungevano la chiesetta, al canto dei Salmi. Erano invisibili, ma il loro coro li rendeva presenti, ed un anno in cui era nevicato, si scorsero le orme di piedi scheletriti...

Costruita tra il 1771 e il 1975, ha una facciata dalle linee neoclassiche divisa in due ordini da cornicioni, quattro lesene la suddividono in sei scomparti in quattro dei quali trovano posto le statue dei Santi Faustino, Giovita, Pietro e Paolo; nei due centrali, piu' larghi, uno ospita il portale d'ingresso preceduto da un pronao eretto nel 1926, e quello superiore una grande finestra; a coronamento della facciata si eleva un geometrico timpano triangolare. Nell'interno, ad una navata, con decorazioni e stucchi che non turbano la solennità dell'ambiente, si puo' ammirare la pala centrale con il martirio dei Santi patroni opera di F. Comerio, ed una tela di G. Ceschini raffigurante la Vergine in gloria e Santi. L'organo, collocato msu presbiterio, e' un Serassi (1806). Nell'attigua sagrestia si conservano una settecentesca Pieta' di Carlo Ceresa, una S. Caterina d'Alessandria entro una ricca cornice intagliata del primo seicento, e un S. Nicolò della Flue del villese Aldo Locatelli (1947).